Mega Man 3, 21. yüzyılda (20XX) belirtilmemiş bir yılda gerçekleşir. Mega Man 2’den 2-3 ay sonra, dünya hakimiyeti için iki kez planları olan çılgın bilim adamı Dr. Wily , reform yaptığını iddia ediyor ve Dr. Light ile “Gamma” adlı bir barışı koruma robotu inşa etmek için bir proje üzerinde çalışmaya başlıyor.
Kontrolleri etkinleştirmek için önce kutunun içini tıklayın. X ve Z tuşları ile oynayabilirsiniz.